علت دقیقی برای زخم های دهانی وجود ندارد. استرس یا آسیب به بافتهای دهانی علت زخم های دهانی  است. غذاهای خاص، از جمله مرکبات یا میوه های اسیدی و سبزیجات (مانند لیمو، پرتقال، آناناس، سیب، انجیر، گوجه فرنگی و توت فرنگی)، می تواند آغاز کننده زخم های دهانی باشد و یا حتی این مشکل را بدتر کند. گاهی اوقات سطح تیز دندان یا لوازم دندانپزشکی و یا اتصالات دندان مصنوعی میتواند باعث زخم های دهان شود.

برفک یک عفونت دهانی است که باعث استوماتیت کاندیدیاز میشود.برفک می تواند هر کسی را تحت تاثیر قرار دهد، هر چند اغلب اوقات در نوزادان و کودکان نوپا، سالمندان و افراد با سیستم ایمنی ضعیف رخ می دهد.عفونت کاندیدیاز به دهان محدود نمی شود؛ ومی تواند در بخش های دیگر بدن مانند بثورات پوشک در نوزادان و یا عفونت قارچی واژن در زنان دیده شود.