آمنوره ثانويه هنگامي اتفاق مي افتد كه چرخه قاعدگي طبيعي يك زن متوقف شود و براي مدتي (بيش از 6 ماه) پريود نشود.

اختلال عملكرد تيروئيد، يك بيماري كاملا شناخته شده در كاهش احتمال بارداري است. علاوه بر اين، هورمون هاي غير طبيعي تيروئيد، الگوي طبيعي قاعدگي را مختل ميسازند. كم كاري تيروئيد در زناني كه در سن باروري بسر ميبرند، بسيار شايع است.

كمبود استروژن زماني رخ ميدهد كه ميزان استروژن در بدن كاهش يابد. كمبود استروژن معمولا در دوران يائسگي اتفاق مي افتد، اما گاهي حتي پيش از دوران يائسگي نيز در زنان رويت ميشود.