نوزادان مبتلا به عفونت مادرزادی ممکن است دچارآسیب خاص به مغز درحال رشد و اندام های حسی باشن  .عوارض عفونت متفاوت است و بصورت عوارض وسیعی نمایان می شود.
 

برخی ازنوزادان،  زمانی که هنوزدررحم مادرهستند، درمورد تشکیل شدن اندامها و قسمتهای مختلف بدن مشکلاتی دارند. مشکلاتی ازقبیل اینکه بدنشان چگونه کارمی کند و یا غذایی که می خورند چگونه به انرژی تبدیل می شود، اینگونه مشکلات بهداشتی به عنوان نقصهای هنگام تولد شناخته می شوند.

 هنگامی که فلج مغزی تشخیص داده  شود،  می توان درمان را برای کودک آغازکرد.

نقص های مادرزادی ناهنجایهای ساختاری یا کارکردی درهنگام تولد هستند که باعث مشکلات فیزیکی مانند معلولیت جسمی یا روانی می شوند. 

باید عدم  تطابق بین محتوای فرهنگی و پس زمینه های فرهنگی درمورد زبان و فرهنگ، کودکان اقلیت ها، کودکان معلول بررسی شود و یک ارزیابی مناسب  برای پیشرفت این کودکان از طریق مراحل رشد در نظر گرفته شود. 

عدم مصرف سیگار ازبعضی مشکلات مانند تولد زودرس،  پایین بودن وزن نوزاد هنگام تولد،  نقایصی مانند شکاف لب یا شکاف کام و مرگ نوزادان پیشگیری می کند.

برخی جوامع قومی با شیوع نسبتا بالایی از جهش ژنتیکی نادری مواجه هستند  که منجر به احتمال افزایش خطر ابتلا به ناهنجاریهای مادرزادی می شود.